Erkek kromozomu, canlının kalıtımını sağlayan genetik materyal olup, üzerinde alel genlerin yer aldığı bir yapıdır. Erkek kromozomu 'Y' harfi ile gösterilir ve erkek bireylerde tek bir tane bulunur. Doğan bebeklerde erkeksi özellikler, babada bulunan Y kromozomundan alınır. Erkeklerde toplam kromozom sayısı 46 olup, bu 44+XY olarak ifade edilir. Y kromozomu, yaklaşık 58 milyon baz çifti içerir ve erkek hücrelerindeki toplam DNA materyalinin %2.5'ini oluşturur.

Erkek kromozomunu oluşturan bu genler, kromozom üzerinde karşılıklı alel genler şeklinde dizilerek bireylerde genotip ve fenotip (dış görünüş) özelliklerinin oluşmasını sağlar. Kadınlarda Y kromozomu bulunmaz ancak bazı kadınlarda erkeksi özelliklerin oluşmasında, çiftleşme ile homolog kromozomlardan erkek olan bireyin Y kromozomundan gen aktarımı gerçekleşir. Y kromozomu, erkeksi özelliklerin oluşmasını ve ortaya çıkmasını sağlar. Günümüzde erkek kromozom testleri yapılmakta ve bu testlerle birtakım sonuçlar elde edilmektedir.

Erkek kromozom testleri çalışmaları sonucu ailelerin soy kütükleri ortaya çıkarılmış ve kalıtsal özelliklerin gen aktarımı ile bireyler arasındaki dağılımları belirlenmiştir. Yüzyıllar önce atalarının nereden geldiği, genetik özellikleri, fenotiplerinin belirlenebildiği erkek kromozom çalışmaları bilime çok fayda katmıştır. Erkek kromozom çalışmaları, DNA materyali üzerinde yoğunlaşmış olup, genetik materyallerin hangi özelliği açığa çıkardığını ortaya koymuştur. Bu çalışmalar ayrıca bazı kalıtsal hastalıkların bireyler arasındaki geçişlerinin izlenmesine ışık tutmuştur.